Киото, вторая половина девятнадцатого века. Призрачная сакура цветет в разгар смуты, когда старый порядок рушится под натиском пушек и пароходов. Синсэнгуми, последний оплот самурайского духа, не просто сражается с ронинами и сторонниками императора. Их клинки разрубают плоть демонов, что выходят из трещин между мирами, питаясь страхом и кровью умирающей эпохи. Капитан первого отряда, Окита Содзи, скрывает за маской чахоточного юноши проклятие древней крови — в полнолуние его катана жаждет не только вражеской плоти. Хидзиката Тосидзо, Железный человек Синсэнгуми, вынужден заключать сделки с кицунэ, чтобы раздобыть серебряные пули для отряда, а Кондо Исами, их лидер, носит в груди осколок зеркала Ята, не позволяющий демонам захватить его душу. Но настоящая угроза приходит не из лесов и храмов. В особняке сёгуна пробуждается древний Они, запечатанный в теле юной гейши, и его планы простираются далеко за пределы политических интриг. Он хочет не просто уничтожить Синсэнгуми, а переписать саму историю Японии, сделав её вечной ночью, где люди — лишь скот для демонов.
Сюжет OVA разворачивается в три дня до решающей битвы при Тоба-Фусими, когда отряд получает приказ охранять тайный проход в императорский дворец. Но вместо людей они находят ловушку: целый квартал превращен в иной мир, где время течет вспять, а тени убитых самураев обретают плоть. Окита, чья болезнь ускоряется из-за демонической ауры, должен решить, пожертвовать ли своей человечностью, чтобы вырвать сердце Они, или позволить Хидзикате сжечь квартал вместе с заложниками. В финале, когда луна окрашивается в багровый, а лепестки сакуры превращаются в пепел, каждый из героев делает свой выбор. Кондо принимает смерть от рук собственных людей, чтобы не стать марионеткой демона, а Окита, истекая кровью, наносит последний удар, разрубая не только тело врага, но и саму связь между мирами. Киото остается стоять, но Синсэнгуми уходит в легенду, оставив после себя лишь мокрую от крови сакуру и вопрос: что страшнее — демоны снаружи или те, что живут внутри человека?