Пятый сезон «Моей геройской академии» начинается с долгожданных совместных тренировок между классами 1-А и 1-В. Ученики разбиваются на команды и сражаются друг против друга в учебных боях, чтобы отточить свои приёмы и продемонстрировать рост. Шинсо, мечтающий попасть на геройский факультет, получает шанс проявить себя в составе класса 1-А. Эти стычки раскрывают не только новые способности, но и старые обиды: напряжение между двумя классами нарастает, особенно из-за самоуверенности Бакуго и скрытности Мономы. Параллельно Мидория пытается разобраться в природе своей причуды «Один за всех», которая скрывает больше секретов, чем он предполагал. Он начинает видеть призраков предыдущих носителей силы, но пока не может с ними поговорить. В это же время Общество освобождения паранормальных способностей, тайная организация, стремящаяся свергнуть систему героев, набирает обороты. Её харизматичный лидер Ре-Дестро убеждён, что причуды должны быть свободны от любых ограничений, и его идеи находят отклик среди недовольных.
Во второй половине сезона сюжет резко сворачивает в мрачную сторону. Все За Одного, находящийся в тюрьме строгого режима Тартарос, передаёт свою волю и часть сил Шигараки. Тот, в свою очередь, вступает в прямой конфликт с Ре-Дестро. Их битва превращается в кровавую бойню, где Шигараки, подпитываемый гневом и амбициями своего наставника, постепенно теряет человеческий облик. Он уничтожает целые кварталы, а его причуда мутирует, делая его практически неуязвимым. Герои, включая Мидорию и его друзей, пытаются вмешаться, но быстро понимают, что столкнулись с угрозой совершенно иного масштаба. Финальные серии показывают, как Шигараки, сломав волю Ре-Дестро, поглощает его организацию и становится новым королём преступного мира. Сезон заканчивается на тревожной ноте: Лига злодеев объединяется с Обществом освобождения, превращаясь в гигантскую армию. Мидория осознаёт, что время мирной учёбы закончилось, и впереди — тотальная война, где на кону стоит само существование героев.