Второй сезон застаёт Кэнту и его команду в совершенно ином положении. После событий финала первого сезона, когда правда о коррумпированной Лиге Героев выплыла наружу, общество раскололось. Кэнта, некогда символ надежды, теперь преследуют как предателя и опасного преступника, чья маска стала мишенью для каждого второго охотника за головами. Он скрывается в трущобах, где собирает вокруг себя тех, кто потерял веру в систему — бывших злодеев, пострадавших от произвола, и простых людей, чьи семьи были разрушены ложными обвинениями. Но настоящий кошмар начинается, когда на руинах старой Лиги поднимается новая угроза: таинственная корпорация «Феникс» предлагает обществу «идеальный порядок» через принудительную имплантацию чипов, подавляющих эмоции и агрессию. Кэнта понимает, что это не спасение, а тотальный контроль, и его борьба перестаёт быть личной войной — она превращается в восстание против самой идеи счастья, купленного ценой свободы.
В то время как Кэнта пытается объединить разрозненных повстанцев, его главный враг — не безликая корпорация, а его собственный бывший наставник, который теперь возглавляет проект «Феникс». Этот человек, когда-то научивший Кэнту носить маску, убеждён, что люди не способны на добро без принуждения, и готов стереть память целых городов, чтобы доказать свою правоту. Кульминация сезона разворачивается в подземном комплексе, где Кэнта сталкивается с ужасающим выбором: снять маску и показать миру своё настоящее лицо, рискуя жизнями близких, или навсегда остаться символом, который уже не принадлежит самому себе. Финал оставляет зрителя на грани — Кэнта жертвует собой, чтобы уничтожить главный сервер «Феникса», но его тело исчезает в пламени, а маска остаётся лежать в пепле. Последняя сцена показывает, как неизвестный ребёнок поднимает её, и на фоне слышен голос, произносящий: «Герой не умирает, пока живёт в сердцах тех, кто готов бороться».
