Тихий провинциальный городок, где каждый день похож на предыдущий. Семнадцатилетний Рётаро всё ещё не может смириться с гибелью отца, учёного, работавшего над секретным проектом в местной лаборатории. Единственное напоминание об отце — старый карманный секундомер, который всегда идёт назад. Однажды, пытаясь завести его на остановке, Рётаро замечает странную девушку в школьной форме, которая стоит на рельсах прямо перед приближающимся поездом. Он бросается к ней, но вместо столкновения мир вокруг замирает, секундомер начинает светиться, и время откатывается ровно на три минуты назад. Девушка исчезает, а на её месте остаётся лишь прозрачная голубая бабочка, которая впивается в запястье Рётаро, оставляя светящийся узор.
С этого момента парень обнаруживает, что может перематывать время на короткие промежутки, но с каждым использованием узор на руке растёт, а в реальности начинают появляться трещины — хронологические разломы, из которых выползают существа, сотканные из искажённых воспоминаний. Девушка, которую он спас, оказывается Каори — агентом Организации по надзору за временными потоками. Она объясняет, что секундомер отца был экспериментальным устройством, способным не просто откатывать время, а закреплять «якоря» в прошлом, меняя ход событий. Но каждый такой якорь разрушает ткань реальности, и если Рётаро продолжит использовать силу, город начнёт рассыпаться на фрагменты разных эпох, смешивая настоящее с прошлым. Теперь ему предстоит понять, что смерть отца не была случайностью — тот пытался исправить катастрофу, которую сам же и создал, и теперь Рётаро должен либо завершить его работу, либо навсегда заморозить время, пожертвовав собственной памятью о близких.
